تهیه پایان نامه بخشی از دوره دکترای دندانپزشکی است که طی آن دانشجو موظف است در زمینه ای مربوط به رشته تحصیلی خود تحت نظر استاد راهنما به تحقیق بپردازد. بنا به پیشنهاد دانشجو و موافقت استاد راهنما و تایید گروه آموزشی مربوطه و شورای پژوهشی دانشکده موضوع پایان نامه تعیین می گردد. دانشجویان دوره دکترای دندانپزشکی می بایست پس از گذراندن حداقل 120 واحد درسی تا یکسال موضوع پایان نامه را با نظر استاد راهنما انتخاب و به ثبت برسانند. فاصله زمان ثبت موضوع پایان نامه تا زمان دفاع آن نباید کمتر از یکسال باشد.