دانشگاه زابل، در بیست و هشت تیر ماه سال 1378 با جداسازی واحدهای تابعه دانشگاه سیستان و بلوچستان مستقر در شهرستان زابل تاسیس و راه‌اندازی شده است. این دانشگاه در قالب دانشكده‌های ادبیات و علوم انسانی، علوم پایه، فنی و مهندسی، كشاورزی، منابع طبیعی و هنر، پذیرش دانشجو دارد.