پياده‌سازي محصولات سيستم‌هاي برنامه‌ريزي منابع سازمان همواره با ريسك روبرو مي‌باشد. آمارها نشان مي‌دهند كه ٦٠ درصد پياده‌سازي اين سيستمها با مشكل روبرو شده است. دليل اصلي كه شركت‌ها از پروژه‌هاي چند ميليون دلاري سيستم‌هاي برنامه‌ريزي منابع سازمان پرهيز مي‌كنند اين است كه خريد يك سيستم برنامه‌ريزي منابع سازمان به تنهايي نمي‌توانند جوابگوي كليه نيازهاي سازماني آ نها باشد. در اين موارد شركت‌ها دو راه‌حل بيشتر پيشرو ندارند. اول اينكه فرآيندهاي خود را به صورت گسترده تغيير دهند تا با نرم‌افزار هماهنگ شوند. در اين موارد حتي ممكن است سازمان مجبور شود فرآيندهايي كه سالهاست سازمان بواسطه آن براي خود مزيت رقابتي ايجاد نموده است را تغيير دهد. در اين موارد ممكن است نقشها و مسئوليتهاي سازماني براي تطبيق با معماري نر مافزار مورد بازنگري قرار گيرد و يا اينكه نرم‌افزار را به صورتي تغيير دهد كه بتواند با فرآيندهاي سازمان هماهنگ شود. اين مسئله ممكن است باعث شود در فرآيند اجراي پروژه تاخير ايجاد نموده و با ايجاد اشكالاتي در فرآيند پياده‌سازي نرم‌افزار، بروزرساني نر مافزار با مشكل روبرو شود. در اين موارد لازم است تا سفارشي‌ سازي در فرآيند توليد نر‌م افزار به صورت گسترد‌ه‌اي صورت پذيرد كه اين مساله باعث مي‌شود هزينه تدارك سيستم به شدت بالا برود. نتايج يك نظرسنجی كه توسط گروه متا انجام شده، بازگ وكننده بسياري از واقعيات در رابطه با سيستم برنامه‌ريزي منابع سازمان مي‌باشد.